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上海交大AI实验室登上Nature头条 自主完成DNA存储全流程

第一电动AI同学
11月8日消息,上海交通大学计算机学院IPADS实验室陈海波、王肇国团队与化学化工学院、变革性分子前沿科学中心樊春海、王飞团队合作,依托张江高等研究院DNA存储研究中心开展研究,成果发表于《自然》杂志并获该刊官网首页头条重点报道。研究团队构建了AI原生科学实验室AutoDNA装置,实现了自主分子生物学实验操作。

据介绍,已有AI自主科学实验室通常由专家预先配置仪器、规定实验流程和设定优化规则,再将人工智能接入文献检索、方案生成或数据分析等局部环节,这种外挂式架构难以适应生物分子实验流程复杂、仪器类型多样以及对实时执行、环境稳定和操作精度要求严格等特点。为此,AutoDNA采用AI原生架构,通过模型、实验与仪器协同设计的思路,构建了面向实验的多智能体架构,将复杂实验任务分解为文献检索、试剂选择、方案设计、代码生成、硬件执行、结果分析和迭代优化等环节,使模型能够贯通设计、实验、优化全过程。

在仪器协同方面,AutoDNA将各类仪器的能力提炼为适合模型理解和调用的原子服务,以自然语言说明和统一代码接口告诉模型每台设备能做什么、如何调用,屏蔽不同型号仪器的底层差异,使模型能够根据实验需求组合设备能力并生成、检查和修正跨设备控制代码。同时,平台将高精度自动化硬件与实验执行调度系统相结合,硬件提供微米级定位和微升级液体处理能力,系统负责程序检查、仪器状态跟踪和资源调度,使多个实验任务在满足时序和操作约束的前提下有序运行。

平台在构建过程中还集成了基于OpenHarmony操作系统的控制终端,并展示了在核酸检测、酶促DNA合成、癌症检测等场景中的应用验证,自主完成了端到端DNA存储的编码、写入、保存、读取与解码流程。

来源:一电快讯

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